Berawal dari santri Assabiqunal Awwalun yang terdiri dari 23 santri, yaitu 1.Ahmad Rofi’, 2.Ahmad Zainul Lubis, 3.Andriansyah, 4.Arseptra, 5.Asep Gunawan, 6. Habibul Kutub, 7.Hafiz Isa M. S, 8.Muhammad Abdul Basyir, 09.Muhammad Ali Zaein, 10.Muhammad Alvil Faiz, 11.Muhammad Ammer Az-Zikra(Alm), 12.Muhammad Dimas Putra, 13.Muhammad Indrawan, 14.Muhammad Sulthon, 15.Muhammad Syafi’i, 16.Said Denni Kurniawan, 17.Salbangun Manik, 18.Sardana, 19.Supriadi Juainy, 20.Syamsul Hadi, 21.Syarif Hidayatullah, 22.Wathoni Akbar, 23.Zainadi Anwar. yang dididik dan diajari secara khusus dan langsung oleh K.H. Muhamad Arifin Ilham (alm) bersama Asatidz Masjid Az-Zikra (Ust. Maulana Jalaludin Al-Hafidz, Ust. Muhammad Surur Al-Hafidz, Ust. Zainil Hakki, Ust.Dikjaya Riswanto, Ust. Ahmad Syuhada, Buya Yahya, K.H. Abah Roudh Bahar, Dr. Amir Faishol Fath, dll*) pada tahun 2013.

            Hingga pada pertengahan akhir tahun 2014 K.H. Muhammad Arifin Ilham (Alm) memutuskan untuk membuka pesantren modern disebabkan perminatan dari jama’ah dan dorongan ulma-ulama serta dari sholat istikhoroh yang beliau lakukan secara istiqomah.  Sehingga didirikanlah SMP-IT AZ-ZIKRA di Masjid Az-zikra Sentul dengan pengurus yang dibentuk dari beberapa santri Assabiqunal Awwalun yang memutuskan untuk langsung mengabdikan diri, dan ditambah dengan asatidz yang di recruit dari luar.

            Pada tahun 2016 mulai dibuka pula jenjang-jenjang berikutnya yaitu MA PLUS AZ-ZIKRA/SMA Sederajat dan MI PLUS AZ-ZIKRA/SD Sederajat yang berlokasi di Masjid Az-Zikra Sentul, disebabkan banyaknya permintaan dari jama’ahnya K.H. Muhammad Arifin Ilham.

            Sedangkan untuk jenjang RA AZ-ZIKRA/TK Sederajat yang berada di Masjid Az-Zikra Sentul sudah berjalan sejak tahun 2012 sebelum didirikannya jenjang-jenjang di atasnya.